由于台湾佛教各道场拥有高度自主性，谁也不管谁、谁也不受谁来管，各自经营一方信徒、发展各自的事业，所以尽管有数十所佛学院开张，但是都自行其事，并没有统一的教育计划、统一的教材课本，学制不确定、课程漫无系统，端看筹办者个人的想法来设立课程，许多筹办者对本身的发展方向也没有明确的概念。有些佛学院开来开去就是那些课，甚至是能请到什么老师就开什么课，老师中途离去，这门课就立即废除，缺乏连贯性，无视或根本无法满足学生的求学需要与吸收能力。

当然，这是因为佛学专业师资有限、能教授的课程有限，但是佛教典籍浩瀚、思想宗派分歧，更相对造成教授完整佛法的困难度。于是即使佛学院的课程计划完善，但往往「事与愿违」

——学期完了接续的不是原计划的课程。结果，学生读了几年书，却没有学到多少东西。在这样的教育环境之下，怎能造就出优秀的人材？这也造成佛学院学生的高流动率，中途辍学、转学的所在多有，若干学生读了好几所佛学院还没有拿到文凭。

三、大环境无法配合，无法学以致用

有些学生读了一所又一所佛学院，宁可在佛学院之间「流浪」，原因之一也是「不愿意」回去常住。因为台湾佛教道场多经忏法会、少弘法讲座，许多学生读了几年书，回常住后，也不得不投入道场忙碌的日常事务当中，使得「英雄无用武之地」，日久下来，「菁英也成了庸常」。有些读过佛学院的学生，很难适应常住师长传统的教育方式，而造成师徒之间关系的紧张，其中不少就此离开道场、独住精舍。结果，师长当初一片栽培的美意，落得徒弟不愿回来，或回来后与人众不和谐的「下场」，这真是情何以堪！许多师长因此对佛学院「视若蛇蝎」，再不许徒弟去读佛学院，这也是造成佛学院收不到学生的一大因素。