他在乡守制经年，赴南京再到杨仁山老居士处求开示。然后东渡日本，停留了几个月，访求佛教遗籍，学习密宗要旨。在东京，结识章太炎、刘师培等一班学人，经常在一起讨论佛学。回国之后，为生计所迫，到广州任两广优级师范讲席，未久以罹风湿病而辞职。后来又与友人李证刚，在九峰山经营农场，又因为大病濒死，而经营不下去。至此，他乃决计舍身为法，不再为生计谋。这时是宣统元年(一九○九年)，他已四十岁。

是年，他再到南京金陵刻经处，依杨仁山老居士，专任校对经书之责。并从仁山老居士学唯识法相之学。宣统三年(一九一一年)八月十七日，仁山老居士示寂，以刻经处编校之责托嘱竟无。越二日，武昌起义，未几革命军攻南京，竟无在危城之中，留守刻经处四十日，经版赖以保全。

民国元年(一九一二年)，他与李证刚、桂伯华、黎瑞甫等七人发起组织“佛教会”，曾得孙大总统复函，准予筹设。竟无乃撰缘起及说明书，还写了一篇〈警告佛子文〉，原意是勉僧徒于佛法式微之际，要团结自救，文字沉痛感人。不意却引起了出家缁众的误会，认为他们斥骂僧尼四众，显欲一举摧灭之。由此引起了缁素相诤。后来，竟无解散了“佛教会”，专志于刻印经书，研究佛典，不复再问外事。又因有感于刻经处规模未充，经费困难，要广刊经典，又苦于刻版之费無著。民国三年(一九一四年)，他只身走陇右，去找蒯若木商借刻版经费。及至由陇右回来，知他十七岁的女儿欧阳兰已在他出门期间病卒，这使竟无哀伤悱愤，不能自己。

蒯若木也是杨仁老很重视的学生，曾到日本留学，回国后在政界作事，杨仁老逝世时，他和竟无、梅撷芸等都在刻经处照料。民国七年(一九一八年)，倓虚法师到北京讲经，临离京时，时任铁路督办的若木，和曾任交通总长的叶恭绰，各捐二千银洋，倓虚法师以此款开办了“观宗学社”。

竟无四十年来，笃学力行，皆激于身心而出，无丝毫假借。他尝说：“悲愤而后有学”，这也是他的切验之谈。爱女逝世后，他在刻经处治“瑜伽学”，常日以继夜，达旦不休。这样才研究出来“法相”与“唯识”本末各殊，未容淆乱。民国六年(一九一七年)，刻经处刻成《瑜伽师地论》五十卷，竟无为作长序，分“唯识”、“法相”为二宗，阐明“约唯心门建立唯识义，约教相建立法相义”的宗义纲要。

民国七年(一九一八年)，竟无考虑著为广弘正法，作育人才，在金陵刻经处开始筹设“支那内学院”。但还是为了经费無著落，迁延著没有结果。为此，他曾经南到云南，为唐继尧督军讲《维摩诘经》、《摄大乘论》；北到北京，为蒯若木督办讲“唯识”，在这二人处得到了一部分资助。

竟无到云南昆明，还遇到了虚云老和尚，是年老和尚七十九岁，也应唐督之邀到昆明。《虚云和尚年谱》中是年载：

已岁暮矣，适欧阳竟无与吕秋逸居士到滇，为“支那法学苑”筹经费，同住圆通寺，请伊请《摄大乘论》，在昆明度岁。