藏传佛教萨迦派主寺。萨迦寺坐落于日喀则西南170公里处的本波山下，仲曲河流经其间，分南北两寺，总称为萨迦寺，为萨迦派的主寺。因其建筑宏大，人员往来众多，曾一度在西藏历史上形成政治文化中心，县城便设此处。早在六十年代，该寺即被列为全国重点文物保护单位。

该寺始祖是吐蕃王朝时期的赞普墀松德赞的大臣昆拔窝伽的三子昆龙王护(即昆禄旺布松)，是西藏最初出家的“七觉士”之一，在桑耶寺随莲花生学佛。昆禄旺布松之子昆宝王(即昆贡觉加布)，继承了师尊卓弥释迦智的传承和别派教法，创立了萨迦教派。1073年(宋神宗熙宁六年)昆贡觉加布40岁时建萨迦北寺，又称“白宫”或“古绒寺”。因该地土质呈灰白色，故称“萨迦”。当时主要宫殿有悉托拉章、古荣木、乌则、仁钦刚拉章、屯曲拉章等，由此形成了宫殿式建筑群。

到了13世纪，该寺第四代法王萨班·贡噶坚赞执政时，豪古王室为了加强对西藏的控制，成吉思汗之孙阔端召西藏有影响的首领萨迦班智达前往凉州商谈西藏归顺蒙古汗王事宜。萨班遵照阔端的旨意，偕侄八思巴和恰那兄弟同往。会晤后，他即写信劝谕西藏各教派首领归附元朝。从此西藏纳入祖国版图。1265年八思巴由大都回到萨迦，开始筹建西藏地方政权，曾在北寺办公。

八思巴追随忽必烈之后，曾多次将皇室贵族等赐给他的财物运回萨迦，用以扩建北寺。在建筑形式上，选择了城镇与寺院相结合的方法，即外形为城堡，中心为佛殿的设计。元世祖至元六年(1269年)，八思巴由萨迦启程回大都，途经吉热寺，盛赞该寺殿堂庄严。送行的萨迦本钦·释迦桑布，心领神会，返萨迦后根据八思巴的旨意立即征派民工，仿吉热寺建萨迦南寺。南寺墙高且厚，东西长约166米，南北宽100米。墙上有40个马面，四角设碉堡。四面有门楼，围墙外环绕人工河。墙上涂有红、白、黑三色：分别象征文殊、观世音和金刚手。萨迦派俗称“花教”即源于此。

南寺为城堡式建筑，呈方形，总面积达14760平方米，全部用灰土筑成。在南面的内外围墙之间，建有拉康拉章，相传为三楼一顶，高度与大殿几乎相等，是八思巴回萨迦时的驻锡之处。在兴建南寺时，北寺也得到大规模扩建，除原有的乌则尼玛殿、乌则萨玛殿及喜脱拉章外，新建了仁钦刚拉章和都却拉章，其规模都相当大。到本钦阿迦龙修建本波日山上的围墙时，萨迦寺已形成大型建筑群。