造成这种主体性不稳固的原因固有多端，但是最显著的原因，当然是政治力量的介入与否。清代的台湾佛教属于萌芽期，暂置不论。日据时代日本佛教之输入，则显然与统治者之改易有关。光复后日本佛教之撤离与大陆汉传佛教成为台湾佛教的主体，也明显地是政治力量介入使然。解严之后的百花齐放局面，则是政治控制力之骤然消失所致。

如果今后的台湾，政治力量能够持续地不再介入宗教发展领域，则佛教的生态，必将成为自由竞争的局面。在教义体系、修持内容、社会影响力、群众基础及财力物力等条件都能居上风者，自然能逐渐成为台湾佛教的主体。否则，由于不适应而被历史淘汰的可能性当然也是存在的。