(二)、日据时代

日据时代的五十年间，台湾佛教有较大幅度的发展与变化。比较显著的是下列几项：

四大法脉的形成：这是以闽南佛教为主轴的汉族佛教，在日据时代所形成的四大法系。亦即：基隆月眉山法脉（善慧开创于基隆灵泉寺）；台北观音山法脉（本圆开创于台北县五股乡的凌云寺）；苗栗法云寺法脉（觉力与弟子妙果开创于苗栗大湖乡法云寺）；高雄大岗山法脉（义永与弟子永定开创于高雄县阿莲乡）。上述这四个根本道场所培养、嗣法的弟子，代代相传，辗转在台湾各地成立甚多寺院，形成了日据时代汉传佛教在台湾的传播网。它们在各地区的影响力，到1990年代的今天，仍然隐约可见。

日本佛教的输入：依据昭和1969年版的《佛教大年鉴》所载，日据时代传入台湾的日本佛教宗派有净土真宗本愿寺派、真宗大谷派、曹洞宗、净土宗、日莲宗、临济宗妙心寺派、与高野山真言宗。这些宗派在日本统治者的襄助之下，快速地在台湾传播，为台湾佛教注入新血。依日据时代台湾佛教学者江木生的统计，到1935年为止，日本各宗派在台湾共设立56座寺院，一座教务所，110座布教所，信徒共约17万人。

台湾佛教的日本化：1915年台南县的斋教徒余清芳，发起对抗日本的西来庵事件。事件失败后，日本统治者开始主导、控制台湾宗教的发展。由日本人主导而成立的南瀛佛教会日后对于台湾佛教的日本（佛教）化，有相当大的影响力。西来庵事件后，很多本土寺院与斋堂担心遭到牵连，纷纷加入日本各宗派的体系、阵营之中。此外，曾经在台湾或日本受日本佛教教育的本地传教者，也逐渐在教义认同、信仰行为、修行方法等方面为日本佛教所同化。因此，如果不是日本战败、台湾光复的话，台湾佛教的全面日本化将是可以预见的历史景象。

佛教徒信仰水准的提高：由于日本来台的各宗传教人员，对佛教教育颇为重视，先后在台湾设立了曹洞宗台湾中学林（即今之泰北中学）、临济宗镇南学林、净土宗台南商业学院等校，以及附设在各寺院的教育机构，因此，培育出不少台湾本土的佛学人材。加上若干赴日本留学回国的弘法人员，也对佛学的弘扬颇为致力，因此，这一时期台湾弘法人员的教育水准，远非清代可比。