闽台两地寺与寺之间关系密切。闽台两地在修建佛寺时经济上相互支持，这种经济支持，以台湾对福建的支持为多，如在二百年前，福州怡山西禅寺的修建，就得到台湾经济上的大力支持。福州鼓山涌泉寺的妙莲和尚，曾赴台湾募化，以修建鼓山寺院。台湾不少寺院，除了在寺院名称、建筑布局、寺院制度等方面与福建寺院相近外，其密切关系还表现在许多寺院是福建寺院的分支，有香火联系，如以福建晋江安海龙山寺分支衍传的龙山寺在台湾有四百九十多座，其中最主要有三座，即：台北万华区的龙山寺，为台北最古老的寺庙，至今这座山门外还立有石碑，上刻“衍自安海龙山寺”。鹿港的龙山寺，其规模格局与安海龙山祖寺几乎一样。被称为台北“三大庙门”的台北艋舺龙山寺，至今香火鼎盛，曾有香客从晋江安海祖寺恭请观世音菩萨分灵住台湾。

福建僧教育的兴盛对台湾僧教育起了推动作用。近代福建僧教育极为发达，一些在闽南佛学院深造或任过课的僧人赴台后，以其丰富经验，积极创办佛学院，取得了显着的效果，如曾求学于闽南佛学院的慈航法师赴台后，创建了台湾第一所佛学院，为台湾僧教育第一人。曾就读闽南佛学院、又在厦门大学讲舍任教的演培法师渡台后任台湾佛教讲习会教务主任，还讲学于新竹女门学院，并任元亨佛学院院长。曾就读厦门南普陀养正院的晋江人常觉法师，赴台后任教新竹女众佛学院、壹同女子佛学院、妙清佛学院、华严专宗佛学院、佛光山丛林学院、香光尼众佛学院等，并任过主严佛学院训导主任，负责过晓光佛学院的工作。这些佛学院教师能开出许多课，与他们早期在闽地的佛学院深造过有关。

闽地许多僧人入台定居弘法，大大推动了台湾的佛教。二十世纪四十年代中末，一批闽地名僧入台，后因海峡两岸阻隔，便定居台湾，积极推动台湾的佛教事业，不少成为台湾佛教界有影响的人物。除了慈航等高僧大德外，有代表性的还有：七岁在福建晋江承天寺出家的晋江人广钦和尚，曾在泉州清源山潜修七年，一九四六年到台湾，先在基隆仙洞隐居一年，后于台北新让修建广明岩、碧潭寺，又建造广照寺、承天禅寺等，并在树林广明寺、台北法华寺、南投仙峰寺、嘉义广照寺等挂名住持。一九八五年，九十五岁高龄的广钦老和尚于高雄县六龟乡宝来村的妙通寺首次传戒，报名者共约二千七百人，其中包括出家众约五百人，为台湾光复后传戒人数最多的一次。在福建福安福庆寺出家的福安东乡人净良，曾在福州鼓山涌泉寺受戒，一九四九年春去台湾，后在台北建弥陀寺，并担任世界僧伽协会的执行委员、台湾「中国佛教会」常务理事、台北市佛教分会理事长，在台湾佛教界有一定影响，曾代表台湾佛教界出席过一九九○年第十七届世界佛教徒联谊会。

闽台两地僧人交往频繁，大大促进了两地弘法活动。这种交往主要可分为三个阶段：第一阶段是一九四九年前。许多闽地名僧前往台湾，如十九岁到福州鼓山涌泉寺出家的虚云法师曾于一九○六年参访台湾灵泉寺；十九岁到鼓山涌泉寺出家的古田人圆瑛一九二四年七月应台湾基隆市灵泉寺善慧和尚之邀，在该寺讲演，并到台中慎斋堂、台南开元寺讲经，八月到台湾新竹金刚寺等处弘扬佛法。这一时期，也有不少台湾学僧赴福建求学，如一九三三年，会泉法师于厦门万石岩开设佛学研究社时，就有台湾学僧前来求学。弘一大师一九三五年春作于泉州开元寺的《心灿禅师传》中，赞誉台湾冈山郡湖内庄人、曾居厦门妙释寺的南山律学苑学员心灿法师一生“沉默谦冲，不露圭角”、“严护威仪、英敢放逸”，称其“高风贞节，盖亦旷世希有”。第二阶段为二十世纪五十年初至七十年代中期。这时期往来不多，一些零星往来主要通过南洋等地中转。 
第三阶段为七十年代末至今。这一时期的交往有多种形式：其一是大型活动。二○○二年二月，应台湾佛教界联合邀请，中国佛教协会副主席、福建省佛教协会名誉会长、南普陀寺方丈圣辉法师率团护送西安法门寺佛指舍利赴台湾供奉，参与赴台的有福建佛教协会副会长兼秘书长本性法师及闽南佛学院部分学僧。

二是法事交流。如一九九八年十一月为例，闽侯雪峰崇圣寺方丈广霖法师与福州怡山西禅寺院首座传和法师联袂赴台进行为期一个月的弘法活动。