明清鼎革，遗民逃禅成为时代风潮。在这股汹涌澎湃的遗民浪潮冲击下，岭南佛门出现了空前的繁荣，据不完全统计，仅皈依在曹洞宗第三十四代传人天然函罡座下的“今”、“古”两辈遗民，包括出家者和居士，就有一百多人。遗民逃禅的风潮不仅对岭南佛门有巨大的影响，对澳门佛教的影响也是至深且巨的。甚至可以说，正是明末清初的遗民僧，掀起了澳门佛教的第一次高潮。

遗民僧中对澳门佛教影响最大的，首推石濂大汕。大汕（1633—1705）字石濂，亦作石莲、石湖，号厂翁，亦号石头陀。俗姓徐，江苏吴县人（一说江西九江人）。大汕“幼而警敏，善画仕女。作诗有佳句，有故出家，踪迹诡秘。”大汕出家的原因不详，有说其曾当过府县门役，因“以讼亡命”而“剪发为头陀装”。中年以后，大汕来到广州，在广州一住30年。初时以卖观音画为生，后得平南王尚之信赏识，住持广州城西长寿寺。大汕交游广阔，经常出入官绅、士人中间，与屈大均、陈恭尹、梁佩兰、吴梅村、陈其年、高士奇、王士祯等名流都有交往。清康熙三十四年（1695）春，大汕应越南阮主时代的显宗阮福周（明王，1692—1725）之请，前往顺化、会安传法。次年满载金银珠宝而归。此时，大汕与岭南名士潘耒交恶，与屈大均等亦皆失和，康熙四十一年（1702）被粤东按察使许嗣兴以“讼上”、“通洋”等罪名擒治，押解至赣州，至于山寺，皈依者甚众，又为江西巡抚李基和逮解回籍，死于常山途次。

大汕天资独具，颇有匠心，能诗会画，通星象律历，善园林设计，喜新奇器玩。著述甚丰，但多已不存，主要著作有《离六堂集》和《海外纪事》。1696年秋大汕回广州后，出巨款修建长寿寺、峡山寺，并扩建澳门普济禅院。长寿寺位于广州城西郊，万历三十四年（1606）巡抚御使沈正建所建，至康熙初已废。经大汕重修的长寿寺，“文木为梁，英石为壁，曲房奥室，备极精工。”具池沼、园林、宫室之胜。内有离六堂，池水与江潮相通，池上复有小桥。清远峡山寺，又名飞来寺，为平南王尚可喜所重建，后转赠大汕作为长寿寺下院。澳门普济禅院祖师堂，是专门纪念禅院开山祖师大汕和尚的内堂，堂内悬挂着大汕的自画像，画中法师长发披肩，目光坦荡。两旁的对联“长寿智灯传普济，峡山明月照莲峰”，道出了他的传法业绩，也透露出这些寺院之间的密切关系。

清代的曹洞宗僧人多出自湛然圆澄和无明慧经门下，其中，前者习称云门系，后者习称寿昌系。清初曹洞宗中影响较大的禅师，乃多出自寿昌系。石濂大汕就是属于曹洞宗寿昌系的僧人，关于其禅法传承，历来争论颇多。大汕的早期学法经历，难以详考。据称曾印法于觉浪道盛，他也自称是道盛的嗣法弟子。

大汕著有《证伪录》一书，批判由霁仑超永等编的御序《五灯全书》。大汕反对《五灯全书》把觉浪定为曹洞宗三十三世之说，而将觉浪定为第二十八世，他自己当然也就是第二十九世传人。这一说法虽然在当时不能被大多数僧侣、文士所接受，但却被澳门普济禅院所承认。今天普济禅院祖堂中的《西天东土历代祖师菩萨莲座》，上写“洞宗第二十九世开建长寿飞来石濂大汕太祖太老和尚”，将大汕视为开山祖师，尊崇备至。