藏传、南传与日本佛教在台湾的发展情势虽然远不如汉传佛教(当代台湾佛教的主流)之盛,但是在解严后也快速地崛起之中。
藏传佛教在台湾光复后开始传入台湾,但是这一时期的弘法者大多系汉族上师。其中以屈映光、吴润江、申书文、刘锐之等人较有成绩。当时的蒙、藏族上师以章嘉、甘珠、格赖达吉、明珠等人较为知名。不过前二位早逝,后二位的弘法活动也不如汉族上师之为世所知。大约在1980年之后,多位藏族名师陆续自尼泊尔、印度、锡金等地来台,或短期传法,或设立精舍,加上这一时期有旅美藏密修行者陈健民的著作集《曲肱斋丛书》在台湾大量流传,藏传佛教在台湾乃引起一阵传播热潮。目前在台湾各地,大约有八、九十处弘法处所。其中,属于宁玛、噶举二派的较多,格鲁派居第三位,萨迦派最少。
南传佛教在台湾的传播重点,是教义与修持方法的弘扬,并不是道场的建立。这一系教法传入台湾的年代也相当晚,大约在1970年代,台湾书商开始影印日译本的《南传大藏经》,若干入门性的南传佛教典籍也逐渐流传于坊间。进入1980年代之后,南传佛法开始较频繁地流传于佛教徒之间。1990年代之后,尤为普及。泰国阿迦曼尊者的修行经历、佛使与阿姜查的教法、居住在缅甸的印度人葛印卡所提倡的“十日禅”、以及缅甸名师马哈希、乌巴庆、帕奥等人的传记或修持法,都在台湾佛教界广泛地流传。在文献方面,南传修持法(大体以四念处法门为主)的著述也有多种被译为中文。已故的大陆学者叶均所译的南传名著《清净道论》也有多处佛学院或道场以之为授课的教材。高雄元亨寺更花费巨资译出《南传大藏经》中文本行世。这对一向偏重北传佛典的中国佛教徒而言,历史意义是相当显著的。
日本佛教虽然在日据时代曾经大量传来,但是光复后又全部销声匿迹。1977年中华佛教居士会与日本新兴宗教灵友会缔结为姐妹会,这是光复后台湾佛教与日本宗教正式交流的第一步。此后,日本新兴宗教陆续入台。其中,由佛教演化而成的教团除了前述的灵友会之外,另有创价学会、本门佛立宗、立正佼成会、阿含宗、真如苑、净土真宗亲鸾会等团体;而传统的日本宗派也有净土真宗、真言宗、日莲正宗等宗先后在台湾成立宗教结社,从事弘法工作。