2009年8月8日，因莫拉克台风袭击，造成台湾各地陆续传出重大灾情。法鼓山慈善基金会自8月8日传出水灾的同时，即针对受创惨重的东部及嘉义以南各县市提供急难救援服务。其中，屏东县林边、佳冬及东港乡，由于淹水情形严重，法鼓山不仅迅速进入灾区提供热食，也积极配合政府社服机构，每日提供受困乡民所需的便当、饮用水以及睡袋，扶助暂居紧急安置所的乡民免于灾后的饥寒。

除了屏东县，法鼓山同样地配合高雄、台南、嘉义及台东等地区的政府单位，供应部分受困民众所需的民生物资，并借由慈基会救灾系统，观测台中、新竹、南投等中部地区目前的受损状况，以便动员救助。由于目前许多乡镇对外桥梁已经中断，在运送物资时，法鼓山义工们常需借助政府之力乘船涉水，才能将物资送到民众手中，而每天负责制作数千个便当的高雄紫云寺法师及义工们，则对于能够有机会及时为他人解决危难、奉献心力，觉得无比的感恩。

法鼓山慈基会副秘书长常法法师表示，依据该会多年急难的救援经验，当洪水退去之后，灾区民众将有一段时间无法获得纯净的饮水及粮食，因此即便台风远去，法鼓山仍将持续配合政府，帮助民众取得生活物资，协助清理家园。此外，对于灾区家境贫寒以及生活困顿的独居老人，法鼓山也将提供急难救助金，帮助他们灾后重建。而在慰访灾区的同时，法鼓山也会告知各地乡镇里长，可以让有经济困难的学生，前来申请慈基会的“百年树人奖助学金”，帮助他们安心完成学业。

目前在东南亚进行弘法关怀的法鼓山方丈和尚果东法师，也特别于风灾的第一时间，对于灾区民众传达慰问及关怀，并期盼法鼓山的信众，能够同心协力，全力帮助灾区民众，度过这次的天灾，做好安心、安身、安家、安业的灾后处理，发挥法鼓山所推动的“心安平安，你就是力量”的精神。