阿底峡尊者时常强调要相信因果业报。当一个人相信名利、权力、手段比较三宝还要深刻的时候，佛法不能进入他的内心。因此，皈依不足以化度他；也不足以感动他行持佛法。菩提心只是为他使用的学持善行，否则任你横机关算尽，所有发自恶心的说话、行为都是日后受报的因。

尊者苦口婆心的劝告众生要抑恶为善。跟着真诚地皈依之後，若能深信三宝，便会依照佛陀的教法行持，而菩提心的彰显便是佛法踏实的履践。所以尊者有“业果者”“三皈依者”“菩提心者”的别名。

佛陀初转法轮时宣说四圣谛，当中就是说到因果的道理。二转法轮时教导以深观空性、无我和诸法宝相来证悟菩提，而这个深观是以慈悲心和菩提心为基础而展开的。佛陀三转法轮开示密乘教法。

密乘是疾速圆满福慧资粮的法门，必须先承事师长，令师欢喜，求得灌顶和随许之後才能修习。阿底峡当时可能已知有些人会说佛法是释尊传下来的，任何人都能修习，不须师承，有缘者自可得道。尊者强调因果业报，在这里可看到它的深意。

阿底峡尊者为求法远赴金洲，为了救度西藏地区信众，纵然自知减寿都毅然前往，可见他追随著释尊的教法和心怀。不过在他圆寂之后，西藏地区就百花齐放，派别兴起，同说密法。所以真正能追随佛陀心灵的修行人实在谈何容易，没有完全的奉献心和广大的菩提心，最终也会被自我打败。