云居寺东南小塔门侧面的天王像

1949年以后，人民政府对云居寺所藏石经进行了发掘和整理。到现在还完好保存的石经就有14，278块，分别藏在对面石经山上的9个洞内和云居寺文物保管所里。1961年3月，国务院将云居寺遣址、两座辽塔、八座唐塔、藏经洞和石经，列为全国重点保护文物，并为保护这些珍贵的文物，先后对辽代北塔进行了加固维修，安装了避雷设施，为保护石经板盖了经板库，以使这些上千年的古代珍贵文物代代相传。北京市人民政府于1985年4月1日决定修复云居寺。第一期工程，天王殿、毗卢殿已竣工开放。原云居寺千年遗物——汉白玉隽刻的圆形山门的雄姿也已复原。为更好地保护石经，避免风化剥蚀，于1999年9月9日9时9分9秒，将全部石经重新秘封于地下。石经藏而天下安，这项举措必成为佛教史上的一件大事。