萨迦寺内的壁画和唐卡都是颇具魅力的艺术精品，其中的130多幅“坛城”壁画，属壁画珍品，素有“经书墙、佛像墙、瓷器墙、壁画墙”四大墙之称，是艺术的宝殿。

萨迦寺是壁画的海洋，宋代的壁画在萨迦都保留了下来，还有元代的壁画。这些壁画的材料用的都是天然矿物质，不容易褪色，是用黄金、白银加上红珊瑚画出来的。还有一些唐卡，最早的宋代唐卡都保存下来了。

唐卡和壁画是西藏寺院绘画艺术的两大奇葩，萨迦寺仅唐卡就存有3000余幅，据鉴定，宋、元、明时期的珍贵唐卡有360余幅。萨迦寺壁画色彩鲜艳、形象生动，除了宗教内容外，壁画还记录了八思巴来往内地和西藏，在北京受封等场面。

正因为萨迦寺有如此独一无二的珍贵文物以及3000余幅精美绝伦的壁画，人们又亲切地称萨迦寺为西藏的“敦煌”。